MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004842	TAC	2	6	77254	77259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_004842	ACC	2	6	77363	77368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_004842	CAAT	2	8	78647	78654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_004842	CG	3	6	78679	78684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_004842	TTA	2	6	78685	78690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004842	ACT	2	6	78717	78722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_004842	GTGC	2	8	78758	78765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_004842	CAA	3	9	78773	78781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_004842	TGG	2	6	80934	80939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004842	TTG	2	6	80972	80977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004842	TAG	2	6	81059	81064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004842	TCGAT	2	10	81106	81115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_004842	GAAT	2	8	81166	81173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004842	AAGA	2	8	81178	81185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004842	GATG	2	8	81192	81199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004842	TGA	2	6	81216	81221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004842	CAA	2	6	81259	81264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_004842	GGA	2	6	81377	81382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004842	TAG	2	6	81407	81412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_004842	AAG	2	6	81507	81512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004842	GTA	2	6	81894	81899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004842	GGA	2	6	81909	81914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004842	CAG	2	6	82122	82127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_004842	AC	3	6	82128	82133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_004842	GTG	2	6	82150	82155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004842	AGG	2	6	82213	82218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004842	TAG	2	6	82237	82242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004842	AGC	2	6	82254	82259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_004842	AAAG	2	8	82268	82275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004842	TCT	2	6	82304	82309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_004842	CCG	2	6	82484	82489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_004842	AGT	2	6	82561	82566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004842	TAA	2	6	82682	82687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004842	GA	3	6	82740	82745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_004842	TGGG	2	8	82803	82810	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004842	ACC	2	6	82813	82818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_004842	CGG	2	6	82967	82972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_004842	GTC	2	6	83224	83229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_004842	ACC	2	6	83238	83243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_004842	TGG	2	6	83299	83304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004842	CCT	2	6	83326	83331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_004842	GCCT	2	8	83404	83411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_004842	TCA	2	6	83578	83583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004842	CGT	2	6	83658	83663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_004842	GTT	2	6	83761	83766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004842	C	6	6	83834	83839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
547	NC_004842	AGATT	2	10	83843	83852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004842	GA	3	6	83869	83874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004842	GT	3	6	83895	83900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004842	TTG	2	6	83956	83961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004842	TGCT	2	8	83985	83992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_004842	TGG	2	6	84036	84041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004842	GA	3	6	84128	84133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004842	GC	3	6	84166	84171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_004842	GTTT	2	8	84186	84193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004842	T	6	6	84191	84196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004842	GGTG	2	8	84222	84229	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004842	GT	3	6	84242	84247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004842	TTG	2	6	84321	84326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004842	CTG	2	6	84365	84370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_004842	GGC	2	6	84393	84398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_004842	GAAG	2	8	84415	84422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004842	GAT	2	6	84504	84509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004842	GC	3	6	86026	86031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_004842	TCGC	2	8	86045	86052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_004842	CCT	2	6	87104	87109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_004842	CG	3	6	87289	87294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_004842	GGA	2	6	90384	90389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004842	CCG	2	6	90390	90395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_004842	TGC	2	6	90444	90449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_004842	A	6	6	90486	90491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004842	CAA	2	6	91258	91263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_004842	GGC	2	6	92584	92589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_004842	TAT	2	6	92593	92598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004842	TGG	2	6	92669	92674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004842	GCCTG	2	10	92755	92764	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_004842	CCT	2	6	92767	92772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_004842	CA	3	6	92790	92795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_004842	CTG	2	6	92801	92806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_004842	CAG	2	6	92814	92819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004842	TGG	2	6	94160	94165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004842	CCG	2	6	95501	95506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_004842	TAC	2	6	95602	95607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_004842	CAA	2	6	95633	95638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_004842	TGGG	2	8	95769	95776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004842	GGA	2	6	95792	95797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004842	CTGT	2	8	97226	97233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_004842	GAT	2	6	98152	98157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004842	GGTAG	2	10	98191	98200	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004842	ACCT	2	8	100479	100486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_004842	TCA	2	6	100549	100554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004842	CCCGC	2	10	100593	100602	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
593	NC_004842	CTTAA	2	10	100668	100677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
594	NC_004842	GCT	2	6	100691	100696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_004842	TCC	2	6	105359	105364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_004842	TTGG	2	8	108957	108964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004842	AAT	2	6	109065	109070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004842	TAG	2	6	111965	111970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004842	GC	3	6	112024	112029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_004842	TGG	2	6	112106	112111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004842	CCT	2	6	112131	112136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_004842	GGTAG	2	10	112233	112242	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004842	GCC	2	6	114235	114240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_004842	TGC	2	6	114254	114259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004842	CTC	2	6	114275	114280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_004842	GTG	2	6	117265	117270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004842	AATA	2	8	117286	117293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004842	TTAT	2	8	117299	117306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_004842	GTG	2	6	117330	117335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004842	CAT	2	6	118114	118119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004842	GCG	2	6	118181	118186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004842	ACA	2	6	120296	120301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004842	CTA	2	6	120308	120313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_004842	CGC	2	6	120490	120495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_004842	TG	3	6	120516	120521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004842	AATT	2	8	120571	120578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004842	GTT	2	6	120609	120614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_004842	GC	3	6	121661	121666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_004842	CGG	2	6	122572	122577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_004842	TGC	2	6	122589	122594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_004842	TGC	2	6	122605	122610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004842	AAT	2	6	122649	122654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004842	GCA	2	6	123304	123309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_004842	CAAT	2	8	125213	125220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_004842	CAG	2	6	126125	126130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_004842	TGT	2	6	126142	126147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004842	CTGG	2	8	126193	126200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_004842	AC	3	6	126285	126290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_004842	AGC	2	6	126328	126333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_004842	ATA	2	6	126382	126387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004842	TGGCTG	2	12	126463	126474	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
632	NC_004842	G	7	7	126809	126815	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004842	TTG	2	6	130099	130104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004842	CTG	2	6	130133	130138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_004842	CAA	2	6	130152	130157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_004842	AGC	2	6	132184	132189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_004842	GCA	2	6	132763	132768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_004842	GTGCTG	2	12	134891	134902	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
639	NC_004842	AGG	2	6	138661	138666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_004842	CGG	2	6	138676	138681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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913	NC_004842	TTTA	2	8	247397	247404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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